Historia[]
Se desconoce el origen y el pasado de Kabuto, pero se sabe que él fue encontrado en las afueras de una aldea destruida por Nonō, una guardiana de un orfanato y sus niños, la monja, al ver la herida en su cabeza, lo cura con su Ninjutsu Médico y luego, le pregunta a cerca de sus padres o su nombre, pero este no sabía. Por eso la monja lo llevo al orfanato donde trabaja, entonces un niño llamado Urushi, un niño del orfanato, le estrella un casco contra su cabeza para no volverse a lastimar, entonces, la monja aclama que, por el casco se llamará Kabuto. Esa noche, mientras trataba de dormirse, este escucha una conversación en la puerta y decide salir a escucharla, sin embargo, este resbala con la puerta y cae al frente de la guardiana que lo rescato y los dueños del orfanato, quienes lo regañan y le dicen a cerca del toque de queda, preguntándole qué hora es, a lo que Kabuto no responde, sin embargo, la monja le pone sus gafas a Kabuto y este logra decirles la hora. Después de eso Nono le regalo las gafas por lo que Kabuto dio las gracias mientras lloraba.
Tras tres años en el orfanato Kabuto aprende a usar Ninjutsu Médico gracias a Nono; teniendo estas habilidades la uso para curar varios ninjas de Konoha y obtener dinero para el orfanato, entre los shinobi estaba Orochimaru, quien le ofrece ser un ninja, Kabuto, rechaza su oferta diciendo que no esta interesado. Un día en el orfanato, Nonō, discute juntos con los dueños del orfanato con Danzō, quien obliga a Nono, a realizar una misión en Iwagakure, amenazándola de quitarle el dinero al orfanato, además, le exige a uno de los niños, Kabuto escucha toda la conversación y se ofrece a ser ese ninja, convirtiéndose en un espía de la Raíz, viajando por todas las naciones. Durante una misión en Iwagakure, Kabuto se encuentra rodeado y recuerda a sus amigos del orfanato, tras esto, un ninja lo ataca con un Kunai, sin embargo, este lo esquiva y derriba al ninja agresor, sin embargo, se da cuenta de que es su madre, Nonō, al ver esto, de inmediato la trata de curar, esta le pregunta quien es y este responde que su hijo, Kabuto, la guardiana no lo reconoce y Kabuto, confundido, deja de curarla e instantaneamente, Kitsuchi y otro ninja de Iwagakure, descubren a Kabuto y lo atacan, sin embargo, Kabuto no les presta atención y sigue confundido, de repente, desde el agua, sale Orochimaru, quien lo recuerda como el ninja que lo curó, diciéndole que era un gran ninja.
Tras este encuentro, Orochimaru lo lleva hacia sus laboratorios convenciéndolo de decirle que había pasado con su madre. Al llegar al escondite, Orochimaru le informa sobre que la raíz los quería eliminar a él y a su madre, Kabuto, impresionado le pregunta el por que, a lo que el Sannin responde que su madre lo quería sacar de la raíz a cambio de asesinar a un ninja, Danzo, acepto esto, sin embargo, engañó a Nonou y le dijo que lo matara a él. Kabuto, impresionado por la historia del Sannin decide atacarlo utilizando su Bisturí de Chakra con el argumento de que Orochimaru acabaria el trabajo de su madre, Orochimaru, simplemente usa el Muda de Cuerpo para evitar el daño y le propone unirse a él en la aldea del sonido, este acepta. Orochimaru también le da una nueva identidad cuando Kabuto regresa a Konoha la cual es: Kabuto Yakushi sobreviviente de la Batalla del Paso de las Campanillas, adoptado y criado por el capitan médico de Konoha. Kabuto también se le es encargado espiar a Akatsuki siendo un discípulo de Sasori para que ejerciera de espía encubierto de Orochimaru, aunque este, finalmente era un doble espía. Poco a poco, gracias a las dotes medicas de Kabuto y su maquiavélica forma de pensar y actuar, se convirtió en la mano derecha del poseedor del poder de la Serpiente Blanca, siendo su asistente y médico personal. También le sirvió su afiliación a Konoha, con lo que podía espiar libremente desde adentro para ponderar la invasión que poco después ocurriría.
Primera Parte[]
Examen Chunin[]
Antes del primer examen Kabuto se relaciona con los nueve novatos mostrándoles las habilidades de algunos ninjas utilizando cartas controladas con su chakra, Durante el segundo examen Kabuto se une con el equipo 7 para terminar la fase pero se encuentra con el equipo Oboro, en la batalla Kabuto es herido por un kunai y allí demuestra su sed de sangre dejando paralizados a los enemigos, lo que da la oportunidad a Naruto de acabar con los oponentes. Al final del examen se reúne con su equipo y por último le muestra a Orochimaru todo lo que aprendió de Sasuke mientras estuvo con él. En las preliminares se retira del examen chunin, para no mostrar todo su potencial y no ser descubierto.
Después Orochimaru previene a Kabuto de no ir a matar a Sasuke o sino acabará con él, pero por ir en contra de Orochimaru fue capaz de acabar con los miembros ANBU que lo protegían para matarlo pero Kakashi intervine forzándolo a escapar. En las Finales del Exámen Chunin se disfraza con el uniforme de un ANBU que asesino y se mezcla con los que protegían a la audiencia. En el enfrentamiento de Sasuke y Gaara utiliza un genjutsu para dormir, empezando con la invasión a Konoha. Después Kabuto envió a varios ninja del sonido tras Naruto y Sasuke, después de esto él y Baki se encuentran con Kakashi y otros ninjas, Kakashi le pregunta por qué huyo de él otra vez y el responde que si lucharan copiaría todos sus jutsus y tendría la ventaja, después de que terminara la invasión Kabuto huye.
La búsqueda de Tsunade[]
Acompaña a Orochimaru en la búsqueda de Tsunade para curar los brazos de él. En el encuentro logra convencerla, y cuando ella iba a cumplir su promesa Kabuto se da cuenta de que quería acabar con Orochimaru y la detiene antes de que acabe con él. Luego pelea contra Tsunade y se toma unas píldoras para aumentar sus habilidades. Luego ella lo deja incapacitado por cambiar todas sus conexiones nerviosas, pero el logra restablecerlas rápidamente. Diciendo la sanin que era aún mejor que ella cuando estaba en el esplendor de su juventud. Luego él se corta la palma de su mano para conseguir una victoria segura ya que Tsunade le tiene miedo a la sangre.
Cuando llegan Naruto y los demás se enfrenta contra Shizune a la cual derrota rápidamente. Luego de que Kabuto piensa en acabar con Tsunade, Naruto se interpone en su camino, pero como Kabuto no ve a Naruto como una amenaza este logra dejarlo K.O con un rasengan impidiéndole regenerarse; pero antes de golpearlo Kabuto logra dañar el corazón de Naruto . Después de recuperarse ayuda a Orochimaru a invocar a Manda, y luego de que esto es derrotado y logra escapar.
La huida de Sasuke[]
Mientras Orochimaru espera la llegada de Sasuke a su guarida para su recuperación, Kabuto le aconseja cambiarse de cuerpo mientras pueda, hasta el punto de llegar a ofrecer su cuerpo pero Orochimaru lo rechaza. Kabuto libera a unos prisioneros y les dice que luchen entre ellos para liberar al ganador pero en realidad era para conseguir un mejor cuerpo a Orochimaru. Kabuto le ordena a Kimimaro traer a Sasuke ya que este es capaz de llegar a sacrificar su vida por Orochimaru , sin importarle el estado en el que se encuentre.
Segunda Parte[]
Sasuke y Sai[]
Cuando el equipo Yamato sale a buscar al espía de Sasori, Kabuto revela ser dicho espia. Yamato disfrazado de Sasori, es capaz de aprender algunas cosas de Kabuto, aunque justo cuando está a punto de capturar a este último aparece Orochimaru. Aunque parece que Orochimaru está a punto de matar a Kabuto por ser un traidor, Kabuto corta la cabeza de Sasori , con la intención de matar al real Sasori bajo las órdenes de Orochimaru. , Yamato llama al resto de su equipo , y Naruto finalmente empieza a luchar contra Orochimaru. Al comienzo de la batalla, Kabuto intenta atacar a Naruto, aunque es casi instantáneamente lanza a una buena distancia por uno de los rugidos de Naruto, noquea en el proceso a Sakura. Regresa de nuevo al puente y cura a Sakura, que había sido atacada por Naruto, y dice que Akatsuki es el mayor enemigo.
Después de la batalla,se va con Orochimaru y con Sai para regresar a su escondite, Kabuto tiene la tarea de dejar atrás a un cadáver que se parece a Sai para evitar que nadie les siga. más tarde Cuando Sai es capturado, Kabuto viene en su ayuda pero el mismo Sai lo captura a él. No se puede escapar, Kabuto proporciona información, y desalienta a Naruto a tratar de recuperar a Sasuke. Kabuto se queda solo con un clon de yamato mientras el equipo 7 busca en la guarida a Sasuke, sin embargo, se escapa para después unirse a Orochimaru y así escapar junto con Sasuke.
El Arribo del Tres Colas[]
Kabuto aparece en un relleno del anime, en donde Orochimaru le encarga a solicitar la presencia de unas subordinada suya llamada Guren entonces este se dirije a buscarla y es atacado por ella simplemente para ver si era digno de ser ayudante de su amo. Sastifecho la lleva a la guarida de Orochimaru, encargándole a las pruebas de las prisiones y de formar un grupo.
Después de que el Equipo Guren no logro vencer a un grupo de ninjas de Konoha, Kabuto procede a ayudarlo a atraer la atención del Tres colas. Cuando la bestia se aparecio le ordeno a Guren detenerlo con su Elemento Cristal, al no lograr frenar a la bestia deciden retirarse para hacerse con una nueva estrategia.
Más tarde se reune en secreto con Rinji que se revela como un espia de Kabuto, cuando se da cuenta de que Konoha intenta sellar al Sanbi el ninja se lleva a Guren y a Yukimaru con el para deternelos.
Después de que fue un exito detener a los shinobis de la Hoja, Kabuto tuvo que tomar medidas desesperadas engañando a Kigiri, Kiho y Nurari sobre que las heridas que tienan les causaria una muerte segura, convenciéndolo de hacerle una operación en esta el ninja le coloca unos Sellos Maldito dandole una fuerza aun mayor. Cuando mata a Rinji se disfraza de este y fue donde Yukimaru para ver si podia liberar su poder para alborotar al Sanbi. Al ver que su plan fallo intento hacer que utilizara de nuevo el poder diciendole que su querida Guren mato a su madre, pero se sorprende al ver que el niño la perdona. A continuación intenta atacarlos como uno de sus bisturies pero son desviados por Naruto, ademas uno de las armas lanzadas dañan la mascara de Rinji haciendo que Kabuto se la quitara. Entonces Naruto y Kabuto pelean pero al ver que el shonibi había mejorado procede a invocar al cuerpo de Rinji para distraer a Guren, al final Kabuto se retira y Guren se queda atrapada dentro de un cristal junto con Rinji.
La Caza de Itachi[]
Después de la muerte de Orochimaru a manos de Sasuke Uchiha, el ninja se implanta los restos del cuerpo de Orochimaru con la esperanza de poder obtener su poder siendo un éxito ya que los restos empezaron a tomar el cuerpo de Kabuto incluso según él se encuentra luchando para evitar que se apodere completamente el. Más tarde se encuentra con Naruto cuando estan buscando a Sasuke regalandole un libro con información sobre Akatsuki y sus miembros como un simbolo de agradecimiento por ayudarle a recuperar su existencia. En esa aparición ya Kabuto tenía su ojo izquierdo igual a Orochimaru y su brazo izquierdo completamente blanco, incluso Hinata con su Byakugan pudo observar que se encuentra un chakra que se ha apoderado un tercio del cuerpo del criminal. Ahí los ninjas de Konoha intentan atraparlo pero se las arregla para escapar.
La invasión de Pain[]
En la invasión de Pain y Konan a la Aldea de la Hoja, Yamato, Anko Mitarashi y Sai intentan encontrarlo, siendo rastreado por un Jutsu de Sai, aún no es conocido el motivo del porque lo buscaban. Luego Danzo envia a los anbu a buscar a Kabuto.
Chikara[]
Después de la implantación de células de Orochimaru Kabuto comienza un viaje por su cuenta durante el cual hace una infiltración en Konohagakure y saquea varias tumbas del cementerio además de infiltrarse en el Bosque del Clan Nara y robar la Guadaña de Triple Hoja de Hidan una vez conseguido el material genético suficiente y robar la guadaña se dirige al Pueblo Tonika en el cual provoca una masacre de sus aldeanos utilizando la Invocación: Resurrección del Mundo Impuro, una vez acaba con los aldeanos comienza una investigación con la cual logra clonar a Hidan y enfrentarse al Equipo Kakashi y varios guardias de Pueblo Hachō.
Después Kabuto se percató de que Naruto se tragó una de sus serpientes y retiró a los revividos por la Invocación: Resurección del Mundo Impuro excepto a Deidara el cual utilizó para causar una humareda y escapar luego se le ve hablando con alguien mediante un pergamino y preparando un nuevo sello para adaptarlo a él y ganar mayor control con la Resurección de Mundo Impuro.
El Confinamiento de los Jinchurikis[]
Kabuto hace su reaparición atacando a unos ninjas de la Aldea Oculta de la Cascada y parece haberse acostumbrado a las habilidades de Orochimaru. Kabuto se encuentra con Tobi, diciendole que averiguo su escondite y su identidad, y que no le subestime, luego de que Tobi lo llamara traidor de Akatsuki, entonces Kabuto utiliza el Edo Tensei, para invocar los cuerpos muertos de Nagato, Kakuzu, Deidara, Sasori, e Itachi. Y diciendole a Tobi que no había ido a pelear sino a unir fuerzas. Despues de eso Tobi le pregunta sobre que ganaria el con esa unión y Kabuto le responde que como esta a punto de comenzar una guerra el puede aumentar su fuerza militar con estos cinco miembros caidos de su organización y que no eran los unicos cuerpos que tenía en su poder, a lo que Tobi le reprocha y le pregunta que quiere a cambio y Kabuto le dice que quiere a Sasuke, pues lo necesita para responder unas preguntas que solo un Uchiha como Sasuke sería capaz de responder.
Entonces Tobi le pregunta sobre que haria si se negara, a lo que Kabuto responde usando el Edo Tensei sacando un ataúd más, esto sorprende a Tobi (que es el verdadero Madara Uchiha) a tal punto de llamarlo loco, Tobi le pregunta que como había podido llegar a ese nivel, Kabuto le responde que no iría ahi sin un plan. Es ahi cuando Tobi reconoce su inteligencia y decide ponerlo a prueba debido a que su fuerza militar había caído. Kabuto vuelve a guardar los ataudes y sigue a Madara, aunque al parecer Kabuto no fue ahí para unir fuerzas pues había dejado un rastro de cuerpos a los ninjas de Konoha que sabía que los estaba persiguiendo. Mas tarde Kabuto esta con Tobi despues de que su nuevo líder se apoderara de nuevo del Rinnegan y en ese momento muestra un nuevo aspecto.
Apesar de que Tobi iba ser quien buscar al resto de los Bijuus, Kabuto se ofrece para ser quien valla y de esa forma mostrar su leatad. Pero en relidad tenía planeado también capturar al experimento de su antiguo maestro Yamato, aunque también dijo que sus experimentos funcionarian si tuviera un Zetsu. Por eso Tobi decide dejarlo ir a la caza y además le prometio darle un Zetsu, ahi su lider decide mostrarle una camara secreta donde se encontraba Gedo Mazo y el cultivo de celulas de Hashirama. Aunque lo que queria mostrar en realidad era sus cien mil Zetsu creados por el chakra de la Bestias con Cola, entonces después de ver todo esto utilizo a Deidara como compañero para ir a su próxima misión en donde el ninja resucitado utiliza un ave de arcilla para poder ir a su objetivo. Kabuto le añade la personalidad a Deidara, pero este talismán es diferente al que usaba Orochimaru, ya que no lo obliga a obedecer completamente a su voluntad. Kabuto es atacado, pero dice que este golpe fue débil, se sorprende al saber que es emboscado por el Tsuchikage, el cuerpo golpeado resulta ser un clon de barro. Al mismo tiempo la isla resulta ser atacada por Manda 2.0, Kabuto explica que fue capaz de usar las células de Mandayconvariasdrogas fue capaz de crear una Manda más grande, fuerte y con sus sentidos más precisos que la original. Kabuto quiere detener la tortuga así que le pide a Deidara que haga una gran bomba, el Tsuchikage los persigue, Deidara dice que se encargara de este, Kabuto lo aprueba mientras se dirige a la isla.
Este al llegar a la isla empienza a buscar a Naruto Uzumaki pero se encuentra con Kurotsuchi la cual intenta detenerlo en ese momento aparecen Yamato, Aoba y Motoi, ahi la ninja Iwagakure logra retener al Akatsuki al utilizar su jutsu de Elemento Lava como un pegamento para inmovilizarlo. Gracias a esto los ninjas intentaron quitarle informacion pero Kabuto se convierte en una serpiente comiendose a Yamato para llevarselo y huir rapidamente para poder ocultarse en una de las fosas nasales de Manda 2.0 siendo un exito, al llevar a la guarida le dice a Tobi que con Yamato podrán hacer más Zetsus.
Cuarta Gran Guerra Ninja[]
Kabuto para evitar que Yamato utilizara sus poderes le inyectó una droga especial que el mismo creo y posteriormente coloca al usuario del Mokuton dentro del árbol de células de Hashirama, ocasionado que el ejercito de Zetsus se volvieran más fuerte. Más tarde ve al ninja invocando a una gran cantidad de tumbas a través de su Jutsu de Resurrección Impura trayendo a la vida no solamente a los Akatsukis muertos sino a los anteriores jinchurikis, a los anterior kages y a todos los ninjas reconocidos en sus aldeas. Ya teniendo a este nuevo ejercito los empezo a mover asi al campo de batalla, apesar de que Tobi estaba preocupado debido a que es muy dificil controlar muchos cuerpos resulta que Kabuto ya tenía planeado quitarle la personalidad y la capacidad de pensar a todas sus invocaciones, y solamente durante el campo de batalla las liberaria un poco para engañar a su enemigo. Pero mientras Kabuto y Tobi hablaban con su su equipo de emboscada, el primero descubre que Anko se encontraba cerca por eso utiliza su Mano Oculta de Muchas Serpientes Sombras contra ella. Al final Kabuto logra ahorcar a Anko pero solamente la deja incosiente.
Más tarde Tobi se acerca donde estaba el ninja y le demanda que mate a Anko ya que había visto el escondite pero este le dice que no puede porque como ella tiene el Sello Maldito de Orochimaru tiene un poco del chakra de Orochimaru, y si lo logra extraer su poder aumentara y de ese modo también el Edo Tensei. Pero aun así Tobi no confía en él y le dice que le muestre todo lo relacionado con su Kinjutsu, entonces Kabuto le pregunto que pasaría si no lo hiciera haciendo que este respondiera que Sasuke no sería suyo. Kabuto sin mas opción ya que aun no podía enfrentarse a un usuario del Rinnegan decidiómostrarle como funciona pero como no tenía ningún sacrifico humano, Tobi saca a Torune y a Fu quienes tenía prisiones ahí Kabuto ve como matan a Torune para simplemente mostrarle a Tobi como funciona su jutsu.
Después de hacer una demostración de como funciona su técnica convirtiendo a Fu en Torune, Tobi queda impresionado y pregunto que si tiene algún riesgo su uso causando que respondiera que "lo bueno de ese jutsu es que no hay ningún peligro". Tobi incredulo le vuelve a preguntar si es cierto y Kabuto le responde que tal vez uno, el de llegar a la fama incluso mas alto que Tobi por lo grandioso del jutsu, Tobi enfadado le da una advertencia y dice que todo tiene un riesgo, Kabuto agradecido le dice que el unico riesgo es aversela explicado y que a los introvertidos les gusta estar aislados e intenta irse pero Tobi le retiene diciendole que todavía no le ha dicho como detener la técnica, a lo que Kabuto le responde que no se puede parar en si la técnica ni matando al usuario, habría que obligarle ha hacer los signos perro, caballo y tigre y luego decir liberación o sellar las almas. Entonces Tobi pensando dice que eso sería simple si diciese la verdad y Kabuto le dice que no se atrevería a mentirle; se despide y se va pensando en que mientras tenga la resurección en esa otra tecnica es invencible y pensando en el futuro aprendera los secretos del Sabio de los Seis Caminos. Volviendo a Tobi le pregunta a Zetsu Negro si le había puesto las esporas de Zetsu Blanco a lo que le responde que sí, le dice que se valla a hacer lo que tiene que hacer.
Al paso del tiempo vuelve a aparecer Kabuto habiendose absorviendo el chakra de Orochimaru del cuerpo de Anko, allí dice que es hora de ponerse serio y habiendo hecho un signo de detras de Zabuza aparece un aura de como una especie de demomio y comenta que Zabuza y Haku intentan apañarselas para evitar ser controlados pero que finalmente solo seran herramientas de masacre sin mente, les quita sus sentimientos para que ballan a luchar, dice que ahora que a absorvido el chakra de Orochimaru la atadura es mucho más fuerte y fue capaz de reescribir los talismanes ya incrustados para que no tuvieran nada de personalidad pero que los que dejo con personalidad fue para que causaran daño psicologico y que se liberaran sus almas, pero ahora los controlara por completo aunque no sabe a cuantos podra mantener asi pero lo descubrira durante la batalla pero a otros los dejara ir por sus propios objetivos y con sentimientos ya que puede suponer una ventaja.
Luego vuelve a aparecer sosteniendo las esporas de Zetsu diciendo que no es tan tonto como para dejar que sus enemigos le sigan el ritmo y demuestra la habilidad de ser capaz de invocar ataúdes a partir de sus anteriores invocaciones, por lo que usa a Gari y Pakura para convocar a los Anteriores Siete Espadachines de la Niebla. Luego usa a Mu para invocar a los otros kage al campo de Batalla cerca de la Cuarta División. Más tarde Kabuto fue visto diciendo que debe fortalecer el sello de Hanzo para que dejara de hacer cualquier otra cosa tanto, pero quedo sorprendido después de ver que le cuerpo de Hanzo no respondía, por lo que Mifune y su división lograron sellarlo.
Después de que Tobi robara a Kohaku no Jōhei y Benihisago donde la Alianza Shinobi había sellado a los Hermanos de Oro y Plata, Kabuto dedujo que Tobi utilizaría el chakra del Nueve Colas para después sellarla en Gedo Mazo. También menciono que de seguro estaba desesperado.
Más tarde, durante el segundo día de la guerra, reaccionó en estado de shock cuando Naruto Uzumaki, en su modo de Chakra de nueve colas derrotó a Toroi al instante con un Rasengan. Luego se ve a Kabuto controlando a Itachi y a Nagato para pelear en contra de Naruto y Killer Bee, parece que Kabuto está actuando a espaldas de Tobi y planea capturar al Hachibi y al Kyubi para chantajearlo.
Se revela que Kabuto planeaba matar a Naruto y a Bee temporalmente haciendo que Nagato usara el Camino Humano, e iba a tomar sus cuerpos y almas con el Camino Naraka para revivirlos después, para así capturar a los jinchuriki sin que Tobi se enterara, pero sus planes se ven frustrados ya que Itachi interviene usando Susanoo.
Kabuto se enoja al saber que Nagato ha sido sellado, dice que es como temía, aún carecía de movilidad y que tenía la intención de protegerlo con las invocaciones del Rinnegan, pero Itachi usó Shuriken en un punto ciego que no pudo esquivar, Kabuto ahora dice que llegó la hora de usar su carta de triunfo. Cuando Naruto estaba peleando con el Tercer Raikage, Kabuto planeó que el Raikage usara la espada definitiva del Puñalada del Infierno: Cuatro Dedos Nukite para destruir la técnica de Naruto y dejarlo medio muerto para capturarlo, pero falló cuando Naruto derrotó al Raikage para posteriormente ser sellado.
Después de que Gaara terminara su pelea contra el Segundo Mizukage, Kabuto se siente aliviado de que el duplicado de Mu fuera sellado antes de que hablara de su jutsu, aunque dijo que esto haria que tuviera que esperar para invocar a su carta del triunfo, que resulta ser el verdadero Madara Uchiha. Este tras la inquietud de parte de Madara de quien era el responsable de su resurrección utiliza a Mu para comunicarse con el primero quien alaga al ninja respecto a su control sobre la técnica, tras ello Kabuto le menciona que ha mejorado su cuerpo desde su apogeo y le pide que le muestre el verdadero poder de los uchiha y Madara entra en accion avanzado entre las filas de la Cuarta División en la que es forzado a usar su Susanoo e inclusive mostrar su Rinnegan que este hecho cercioraba la hipótesis de Kabuto de que el Rinnegan es una evolución del Sharingan y que el cuerpo de Madara es tan poderoso ahora gracias a las modificaciones de parte del bífido ninja, tras esto Madara atrae un asteroide para demostrar que ese poder no era por las modificaciones de Kabuto.
Luego de que Mu se recupera del golpe hecho por uno de los Kages, Kabuto empieza a darse cuenta de la estrategia de usar la niebla para dificultad la visión del Rinnegan y de cómo Onoki aligeró el cuerpo del Raikage para que fuera más rápido, pero pensó que el efecto sería el mismo que tuvo cuando Onoki y Kabuto pelearon sin embargo resulto todo lo contrario.
Cuando Itachi logra llegar hasta donde Kabuto está oculto, Kabuto se ríe diciendo que el Edo Tensei no puede ser parado si es asesinado, que sólo él puede detener el jutsu. Kabuto, excitado por que su recompensa de la guerra había llegado directamente a donde el, le dice a Itachi que le diría las debilidades sobre el jutsu de resurrección del mundo impuro pero que no cree que Sasuke se quedaría callado por tanto tiempo. Luego intenta utilizar el odio de Sasuke en su contra para que lo ayude en contra de Itachi. Sasuke que ahora sabe la verdad sobre Itachi escoge juntarse con su hermano que con Kabuto. Con esto Kabuto se prepara para batalla.
A continuación se descubre que Kabuto se ha implantado genes de los antiguos compañeros de Sasuke y con ello conseguir nuevas habilidades (puede convertir su cuerpo en agua, puede sanar su heridas a una gran velocidad y usar la habilidad de jugo de absorber energía de la naturaleza para dominar el senjutsu serpiente) también entrenó con la sabia serpiente blanca para convertirse de serpiente a dragón superando el poder de su maestro. Kabuto lanza un sennin jutsu hakugeki, que anula la visión y oido de Itachi y Sasuke, entonces Kabuto aprovecha para atacar a Sasuke, que es protegido por el Susanoo de Itachi. Kabuto le pregunta como ha podido preveer su movimiento e Itachi le responde que es porque sabe perfectamente lo que está pensando, e imaginaba que primero intentaria capturar a Sasuke, mientras Kabuto halaga a Itachi, Sasuke lanza un ataque por sorpresa que no da resultado. Itachi pregunta a Sasuke si recuerda cuando fue con él para ocuparse de Inoshishi (un jabalí gigate) hace años, y él responde que sí. Entonces usan la misma estrategia que usaron para derrotar al jabalí, aunque esta vez fue con sus Susanoo y contra Kabuto, pero resulta no funcionar, Kabuto coge una espada y atraviesa a Itachi, pero resulta ser un genjutsu e Itachi solo consigue cortarle un cuerno. Itachi le dice a su hermano que "ahora, enfrentarte a un jabalí tan grande como ese, es fácil para ti", y Sasuke le responde que en vez de enfrentarse con un jabalí gigante la prioridad es enfrentarse con esa serpiente, e Itachi lo afirma.
Después de la discusión, Kabuto trata de persuadir a Sasuke, dándole ilusiones de una hermandad ya que hace recordar a Sasuke de los problemas que causo en Konoha, de la traición a sus camaradas, y de lo que podía hacer si se unía a él, entonces Sasuke recuerda una vez en la que encubierto con Tobi, escuchan la conversacion de dos ninjas de la hoja, al escuchar que hablaban de su hermano como un criminal Clase S, se enfadó, en esto Tobi dijo que se calmara, ya que aunque contara toda la verdad, ni la misma Hokage le creería, en esto, Itachi le dice que no le crea, que no pusiera atencion a lo que decia puesto que él era mejor mentiroso que el, entonces Kabuto hace alusión a la vida de Sasuke como la de él, entonces Itachi, dice que el aún sigue siendo un ninja de la hoja, entonces empieza a hablar de una forma para vencer a Kabuto, la cual extinguiría la luz de sus ojos, entonces Sasuke al preguntar si era el Izanagi, el responde que no, que es la pareja esencial que puede determinar el destino, en esto Kabuto ataca, e Itachi libera el Izanami.
Kabuto, al no saber en que consiste la técnica, la cuestiona, y luego, decide atacar con su Arte Sabio: Transmigración Inorgánica, logrando atravesar un poco a Itachi, el Uchiha, se empieza a regenerar por el Edo Tensei y le aclama a Kabuto que cometió el mismo error que él, pues fue un espía que vive en un mundo de mentiras, Kabuto, recuerda su duro pasado y luego aclama que no saben nada de él, absolutamente nada.
Después de recordar su pasado, Kabuto dice que con el fin buscar su identidad necesita recolectar toda la información de todas las cosas del mundo, y por eso necesita a los hermanos Uchiha y asimilar sus habilidades. Después de que Itachi refuta las creencias de Kabuto, este último saca de su cuerpo una figura con la apariencia de Sakon que salio desde la base de su ombligo. Inmediatamente la figura de Sakon se vuelve en Jirobo y con ella Kabuto usó un jutsu de Elemento TIerra para alejar las llamas de Amaterasu que se encontraba en su camino, luego hace aparecer a Kidomaru para lanzar una telaraña la cual es contrarestada por otro Amaterasu hecho por ambos Uchiha, y después Kabuto hace aparecer a Kimimaro con quien usa la Danza del Helecho. Allí se revelo que le había tendido una trampa a los hermanos ya que Kabuto antes de haber intercambiado por Kimimaro lanzo una teleraña por detrás, por lo que los Uchihas quedaron atrapados entre los huesos y la telaraña. Luego de que los Uchihas se salvan, Kabuto saca una figura de Tayuya con quien realiza un Genjutsu para inmovilizarlos, y seguidamente saca una figura de Orochimaru que toma su forma verdadera de serpiente. Después de que Itachi volvio a cuestionar las creencias de Kabuto, este mando al ataque a Orochimaru pero la serpiente fue detenida por los hermanos quienes se liberaron del Genjutsu. Cuando Itachi estaba a punto de llevar acabo el Izanami, Kabuto sale de la boca de Orochimaru y corta a la mitad a Itachi con su Bisturí de Chakra.
Tras el corte Kabuto intenta tomar el control de Itachi pero Sasuke lanza su espada, en ese momento la serpiente de Kabuto la detiene y luego utiliza su Susanoo para intentar atraparlo obligandolo a alejarse, entonces Sasuke usa su Elemento Fuego: Jutsu Gran Bola de Fuego pero Kabuto lo detiene con el Elemento Agua: Jutsu de Gran Casacada que vence al ataque de Sasuke y lo envía contra la pared, sin embargo, Itachi se regenera y aprovecha el momento para atacar a Kabuto liberando el Izanami, perdiendo la luz de su ojo izquierdo, a pesar de ello Kabuto confía en que su membrana de ojo lo protege de cualquier Genjutsu y continua la pelea, sin saber que desde ese momento Kabuto cae en una especie de bucle del tiempo en el cual repiten las acciones ya pasadas siendo esto el efecto del Izanami, al que estaba expuesto por Itachi, quien, lo tiene completamente inmovilizado.
Después se le ve a Kabuto luchando contra Itachi dentro del bucle del Izanami, luego piensa que si no estuviera atrapado estaría ganando la guerra, se ve a su hermano Urushi que esta peleando en la guerra curando a un amigo y Urushi dice que espera volver a ver a Kabuto en el orfanato, por ultimo Itachi dice que parará el Edo Tensei. Luego, Itachi, mientras dialoga con Sasuke, le abre los ojos a Kabuto, aún atrapado en el bucle, y utiliza su Genjutsu: Sharingan para obligar a que éste le revele los sellos de la Resurección Impura y porcede a obligarlo a ejecutar la liberación.
Después de que Sasuke decide revivir a Orochimaru mediante el Sello Maldito del Cielo de Anko, Jugo ayuda a Sasuke al absorber parte de la carne de Kabuto para que la técnica funcione. Después de ser revivido, Orochimaru reabsorbe todo su chakra del cuerpo de Kabuto, por lo que deshace todas sus modificaciones, quitandole su cuerpo de serpiente, devolviéndolo a su estado humano.